Lembaga Pendidikan Ponpes Terpadu Al Musthafawiyah
MTs
Pendidikan tingkat menengah pertama yang memadukan kurikulum nasional dengan penguatan pembelajaran ilmu-ilmu keislaman.
SMPIT
Program pendidikan menengah pertama yang mengintegrasikan kurikulum nasional dengan nilai-nilai Islam dan pembinaan karakter.
SMKIT – Farmasi
Program kejuruan yang menyiapkan tenaga ahli farmasi dengan Sertifikasi Profesi Teknis Farmasi dan Asisten Apoteker, dengan menekankan pada pembentukan akhlak dan kepribadian Islami yang kuat.
SMAIT
Program pendidikan menengah atas yang mengintegrasikan kurikulum diknas dengan nilai-nilai keislaman untuk persiapan ke perguruan tinggi.
Takhassush (Tahdiz Al-Qur’an)
Progam pendidikan pembelajaran 6 tahun yang melahirkan kader-kader penghafal Al-Qur’an bersanad (Hafal) 30 Juz
MA
Pendidikan menengah atas yang mengacu pada kurikulum Kementrian Agama dengan pendalaman ilmu-ilmu keislaman untuk persiapan ke perguruan tinggi ilmu agama islam atau kuliah di Timur Tengah.
SMKIT – DKV
Program kejuruan yang membekali siswa dengan keterampilan desain digital dan multimedia dalam bingkai nilai-nilai Islam.